Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFTRP13569 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFTRP13569 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFTRP13569 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms