Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PIGN-226ENST00000638591 2776 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms