Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BP0C0L5 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
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