Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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