Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C4orf47A7E2U8 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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