Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms