Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms