Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO1Q9P1Z2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO1Q9P1Z2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO1Q9P1Z2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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CALCOCO1Q9P1Z2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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