Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CTNNBIP1Q9NSA3 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms