Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms