Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SIN3AQ96ST3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIN3AQ96ST3 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms