Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC84Q86UT8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms