Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms