Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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