Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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RTL8BQ17RB0 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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