Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
IMPG1Q17R60 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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