Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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