Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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LSAMPQ13449 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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