Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms