Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FOXD4Q12950 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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