Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PTPRJQ12913 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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