Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FMODQ06828 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms