Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
E2F1Q01094 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms