Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MCCD1P59942 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MCCD1P59942 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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