Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSCP56915 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSCP56915 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSCP56915 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms