Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL23P55773 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL23P55773 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms