Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBP50607 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBP50607 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBP50607 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBP50607 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBP50607 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBP50607 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBP50607 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms