Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NESP48681 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NESP48681 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NESP48681 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NESP48681 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NESP48681 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NESP48681 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms