Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMPOP42166 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMPOP42166 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMPOP42166 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TMPOP42166 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMPOP42166 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMPOP42166 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMPOP42166 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms