Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP8P40818 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP8P40818 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP8P40818 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP8P40818 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP8P40818 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP8P40818 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP8P40818 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms