Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRHRP34981 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRHRP34981 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms