Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRMP28827 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRMP28827 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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