Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms