Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM21P19474 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms