Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GM2AP17900 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GM2AP17900 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GM2AP17900 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GM2AP17900 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GM2AP17900 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms