Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA4P13612 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms