Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC192P0DO97 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms