Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EXTL3O43909 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms