Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1E9PL57 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms