Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HHLA1C9JL84 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms