Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3CA6NKF2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID3CA6NKF2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms