Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
V9GYQ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
V9GYQ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
V9GYQ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
V9GYQ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
V9GYQ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
V9GYQ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
V9GYQ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
V9GYQ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYQ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYQ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYQ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYQ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYQ6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYQ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
V9GYQ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYQ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYQ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYQ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYQ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYQ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
V9GYQ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYQ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYQ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYQ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
V9GYQ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms