Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC23IPQ9Y6Y8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms