Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRPRBQ9Y5M8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SRPRBQ9Y5M8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRPRBQ9Y5M8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms