Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB9Q9Y5E1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB9Q9Y5E1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms