Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A0

JRKL, Jerky protein homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKLQ9Y4A0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
JRKLQ9Y4A0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
JRKLQ9Y4A0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms