Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED5Q9Y3A6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED5Q9Y3A6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms