Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED16Q9Y2X0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms