Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
YBX2Q9Y2T7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
YBX2Q9Y2T7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms