Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NOD1Q9Y239 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms